Las bacterias tienen varias aplicaciones útiles en relación al tratamiento de ciertas enfermedades y en la elaboración de alimentos.
En la industria son bastante conocidas las bacterias del género Acetobacter, que oxidan el alcohol etílico transformándolo en ácido acético, esa relación permite constituir la base del vinagre.
En el dominio farmacéutico se usa Propionibacterium freudenreichii para la producción de la vitamina B12.
En el sector químico se usa el Bacillus thuringiensis israelensis para la confección de insecticidas biológicos.
En cuanto a la alimentación, la grasa es sintetizada por bacterias del género Nocardia.
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