El movimiento de reforma católica, también conocido como la Contrarreforma, se ha desarrollado desde la edad media cuando los clérigos han dado cuenta de la necesidad de una revisión en las prácticas eclesiásticas. Sin embargo, tomando acciones más enérgicas contra la fragmentación del poder religioso desarrollado sólo con la aparición de las religiones protestantes.
Una de las primeras medidas adoptadas por la iglesia fue restaurar el Tribunal del Santo Oficio (Santa Inquisición), que sirvió en la edad media contra los movimientos heréticos. Durante el mandato del Papa Paulo III (1468-1549) fue organizado uno de los eventos más importantes de la historia católica: el Concilio de Trento. Esta reunión tuvo como objetivo principal buscar una definición de la iglesia hacia el establecimiento de las religiones protestantes. Después de los debates, fue establecido el refuerzo de los dogmas católicos, la preservación de todos los actos litúrgicos, la confirmación de la transubstanciación, el celibato y la jerarquía clerical.
Con respecto a la crisis moral que experimentó internamente la iglesia, los participantes del consejo rechazaron la venta de indulgencias y alentaron el establecimiento de seminarios teológicos responsables de mejorar la formación religiosa de los futuros miembros de la iglesia. En una de las reuniones celebradas por los líderes católicos, fue definido el Index Librorum Proibitorum, que consistió en una lista de obras que no debían ser apreciadas por los cristianos católicos verdaderos. Esa lista negra incluía obras como Elogio de la Locura (Erasmo de Rotterdam), las traducciones protestantes de la Biblia, las obras del italiano Boccaccio y el Libro de Oración de Fray Luís de Granada.
Otra acción que marcó el movimiento de la Contrarreforma fue la creación de las órdenes religiosas. La más importante de ellas fue la Compañía de Jesús, fundada por el clérigo Ignacio de Loyola, fundada en 1540. Su papel fue de gran importancia en la conversión religiosa de los pueblos colonizados en las Américas. De entonces en adelante, la iglesia logró estrechar sus lazos y contener el avance desenfrenado de la religión protestante. Sin embargo, el nuevo contexto de la diversidad religiosa había creado un mundo marcado por diferentes conceptos de la fe y la vida. De esta manera, la identidad del hombre moderno se calzaba con el relieve de la individualidad y el libre albedrío. Sin embargo, podemos ver que la sensación de liberad ofrecida por el propio protestantismo fue combatida por sus líderes. La intolerancia religiosa y el combate a la brujería también fueron responsables por un movimiento inquisidor entre los protestantes.