El proceso evolutivo implica dos mecanismos de especiación conocidos como anagénesis y cladogénesis.
- Anagénesis (ana = hacia arriba; génesis = origen) representa la evolución progresiva de los caracteres que aparecen o se modifican, alterando la frecuencia genética de una población. Por lo tanto, una innovación orgánica, favorable o desfavorable, seleccionada y adaptada al medio ambiente. Generalmente se establecen por eventos relacionados a la mutación y permutación en cromosomas homólogos.
- Cladogénesis (clado = rama): comprende la rama filogenética, causando una ruptura en la cohesión de una población, que en función de continuas transformaciones anatómicas y funconales, en respuesta a las condiciones ambientales, resultan en la dicotomía (separación, en este caso en grupos) de la población, estableciendo diferencias capaces de originar clados no compatibles.