La región fue habitada por la civilización maya antes de la llegada de los españoles en 1502. Honduras fue independizada de España sólo en 1821, produciéndose la adhesión a México.
Honduras se unió a la Federación Centroamericana y obtuvo su independencia en 1838. El país experimentó una dictadura entre los años 1932 a 1949. Después de este período llegó gobiernos frágiles, interrumpidos por golpes militares.
La elección de un presidente civil se llevó a cabo sólo en 1981. En la década de 1980, Nicaragua, el país vecino, tuvo el poder tomado por la llamada guerrilla sandinista. Honduras apoyó a los contras, nombre otorgado a los rebeldes anti-sandinistas.
Con base en Honduras y el apoyo de EE.UU., los rebeldes atacaron Nicaragua. En consecuencia, se levantaron tensiones entre ambos países. Nicaragua y Honduras disputaron el Golfo de Fonseca en la costa del Pacífico.
